肾为五脏之一，肾系是指肾及其直接相关联的脏腑、官窍、经络等组织结构的总称，包括了肾、膀胱、骨、髓、女子胞、精室、耳、二阴、足少阴肾经、足太阳膀胱经等。
（一）肾
肾位于脊柱两侧，紧贴腹后壁，居腹膜后方，红褐色。《素问·脉要精微论》说：“腰者，肾之府。”1.《难经·四十二难》说：“肾有两枚，重一斤一两。”
2.明代张景岳《类经图翼·足太阳膀胱经图》：“肾有两枚，形如豇豆，相并而曲附于脊之两旁，相去各一寸五分，外有*脂包裹。”
3.明代赵献可《医贯·内经十二官论》曰：“肾有二，精所舍也，生于脊膂十四椎下，两旁各一寸五分，形如豇豆，相并而曲附于脊外，有*脂包裹，里白外黑。”
4.可见，中医对肾的解剖认识大体如下：肾有两枚，左右各一，基本对称分布于第一腰椎两侧，各相距腰椎一寸五分，状如豇豆，有*脂包裹。这些认识同现代解剖所见基本相符。
（二）肾与膀胱相表里
肾与膀胱相络属，相为表里，膀胱的生理病理皆与肾密切相关。《灵枢·本输》云：“肾合膀胱。”1.肾与膀胱相表里，共同完成“藏津液”与“气化则能出”的过程。如肾阳失司，则可能造成“膀胱不利为癃，不约为遗溺”。
2.临床治疗小便失常的病证，亦多从治肾着手。如膀胱虚证，则以温肾固气为主；膀胱湿热，或肾移热于膀胱，出现小便短赤，或癃闭、尿血等症时，宜用清热利湿之法。
3.《血证论》云：“肾者水脏，水中含阳，化生元气，根结丹田，内主呼吸，达于膀胱，运行于外，则为卫气。此气乃水中之阳，别名之曰命火。”
这说明膀胱受肾中阳气，通过其经脉外达于体表而卫外。肾阳之盛衰，关系到膀胱足太阳主表卫外的强弱。肾阳充实，则太阳之阳气必盛，卫外功能亦强；肾阳不足，则太阳之阳气必衰，卫外功能减弱。
（三）肾在体合骨，其华在发
肾在五体主骨，其华在发
1.《素问·宣明五气》曰：“肾主骨。”
2.《素问·阴阳应象大论》曰：“肾生骨髓。”
3.肾精充足，骨髓生化有源，骨骼得到髓的滋养而坚固有力。若肾精虚少，骨髓化源不足，不能营养骨骼，便会出现骨骼脆弱，不能久立，在小儿多见发育不良。
4.肾既主骨，而“齿为骨之余”，齿与骨同出一源，牙齿也由肾中精气所充养。
中医学认为发与肾有密切关系，称“发为血之余”
1.《素问·六节藏象论》：“肾者，主蛰，封藏之本，精之处也，其华在发，其充在骨，为阴中之少阴，通于冬气。”
2.《素问·五藏生成》曰：“肾之合骨也，其荣发也，其主脾也。”
3.由于发为肾之外候，所以发的生长与脱落、润泽与枯槁常能反映肾中精气的盛衰。一般说来，青壮年肾中精气充盛，发黑而光泽；老年人肾中精气渐衰，发白而枯槁并易于脱落。临床上对于脱发等毛发的病证，多从肾论治。需要提及的是，不仅头发与肾有关，反映第二性征的须髯、腋毛、阴毛等，其分布，稠密稀疏也多能反映肾精的盛衰变化。
（四）肾开窍于耳及二阴
肾开窍于耳
1.《素问·阴阳应象大论》曰：“肾主耳……在窍为耳。”
2.《灵枢·五阅五使》曰：“耳者，肾之官也。”
3.《灵枢·脉度》曰：“肾气通于耳，肾和则耳能闻五音矣。”
4.《灵枢·师传》曰：“肾者主为外，使之远听，视耳好恶，以知其性。”
5.《灵枢·本藏》根据耳廓的颜色、形状、大小来判断肾脏疾病：“黑色小理者肾小，粗理者肾大，高耳者肾高，耳后陷者肾下，耳坚者肾坚，耳薄不坚者肾脆。”
6.《难经·四十难》曰：“耳者肾之候。”
这些文献都从生理、病理上论证了耳与肾的关系。
二阴与肾也有密切关系
1.《素问·五常*大论》曰：“肾其畏湿，其主二阴。”
2.前阴有精窍，与溺相附，而各不同，溺窍内通于膀胱，精窍则内通于胞室。女子受胎，男子藏精之所，尤为肾之所司。肾的生理功能异常，可导致生殖功能障碍，男子可见阳痿、早泄、少精、滑精、遗精等症，女子可见月事不调、性欲淡漠，甚则闭经、不孕等。
（五）肾在液为唾
肾在液为唾，唾为口腔中分泌的液体。口中之液清者为涎，稠者为唾。
《素问·宣明五气》说“肾为唾”，《灵枢·九针论》说“肾主唾”指出唾为肾液。肾主水，唾为水液的一部分，故亦为肾所主。
通过唾液量的多少变化，可以反映体内津液的盈亏以及水液代谢的正常与否。如唇焦齿槁，口干舌燥，少唾甚或无唾等表现常见于肾阴虚之人；多唾则责之于肾阳虚。
生理的唾液为肾精所化，咽而不吐，有滋养肾中精气的作用。若多唾或久唾，则易耗伤肾中精气，所以前人极为重视唾液，有“金津”“玉液”“醴泉”“甘露”等名称，认为唾液可以灌溉脏腑，润泽肢体。明代李时珍就认为如果人能终日不唾，则精气常留，颜色不槁。所以中医的养生家、气功家都特别重视咽津，即以舌抵上腭，待津唾满口后，咽之以养肾精。
（六）肾在志为恐
恐为七情之一，七情各有脏腑所主，肾主恐。恐与惊相似，但惊为不自知，事出突然而惊；恐为自知，俗称胆怯。
《素问·阴阳应象大论》说：“人有五脏化五气，以生喜怒悲忧恐。”《素问·阴阳应象大论》中“在志为恐”“恐伤肾”，等词句说明恐与肾有着密切关系。
在病理情况下，过度惊恐每易伤肾。《素问·阴阳应象大论》直言：“恐伤肾。”《素问·举痛论》曰：“恐则气下……恐则精却，却则上焦闭；闭则气还，还则下焦胀，故气不行矣。”
张景岳认为恐惧伤肾则伤精，则升降不交，故上焦闭，上焦闭则气归于下，病为胀满而气不行，故恐则气下，可见恐伤肾主要是影响肾的气机，使肾的气机逆乱，气泄于下，肾气不固，所以恐伤肾常出现二便失禁，或遗精滑泄，阳痿阴缩，腰酸腿软，气上冲胸等临床表现。此即《灵枢·本神》所言：“恐惧而不解则伤精，精伤则骨酸痿厥，精时自下。”《金匮要略·奔豚气病脉证并治》所说：“从少腹起，上冲咽喉，发作欲死，复还止，皆从惊恐得之。”
（七）肾藏志
“志”有意志、毅力、决心之意，属于五种精神意识活动之一，由肾所主。《灵枢·本神》云：“意之所存谓之志。”“肾藏精，精舍志。”
如果肾精充盛，则表现为意志坚定，有毅力，对外界事物有较强的分析、识别和判断能力，对外界事物的处理就表现出足智多谋，反应灵敏，活动敏捷有力。若肾精不足，则表现出意志消沉，对外界事物分析、识别能力下降，处事优柔寡断，精神萎靡不振，呆滞，行动迟钝。
（八）肾经与络脉
《灵枢·经脉》曰：“肾足少阴之脉，起于小趾之下，斜走足心，出于然骨之下，循内踝之后，别入跟中，以上踹内，出腘内廉，上股内后廉，贯脊，属肾，络膀胱。其直者，从肾上贯肝膈，入肺中，循喉咙，挟舌本；其支者，从肺出络心，注胸中。”
足少阴肾经的循行路线：足少阴肾经，起于足小趾之下，斜行于足心（涌泉穴），出于舟骨粗隆之下的然谷穴，沿内踝后，分出进入足跟，向上沿小腿内侧后缘，至腘内侧，直上股内侧后缘，贯通脊内（长强穴），穿过脊柱，属于肾，络膀胱。直行线从肾上行，穿过肝和膈肌，进入肺中，至俞府穴沿喉咙上达舌根两旁而终。另一分支，从肺中分出，络心，注于胸中（膻中穴处），交于手厥阴心包经。
肾经异常特征：耳聋、咽喉肿痛、腰脊强痛、腘内廉痛、小腿内侧痛、足跟痛，足心热、肾经循行部位的病证（下肢厥冷、内踝肿痛）等。
（九）膀胱经与络脉
《灵枢·经脉》曰：“膀胱足太阳之脉，起于目内眦，上额，交巅。其支者：从巅至耳上角。其直者：从巅入络脑，还出别下项，循肩膊内，夹脊抵腰中，入循膂，络肾，属膀胱。其支者：从腰中，下夹脊，贯肾，入腘中。其支者：从膊内左右别下贯胛，夹脊内，过髀枢，循髀外后廉下合腘中，以下贯踹内，出外踝之后，循京骨至小指外侧。”
足太阳膀胱经的循行路线：足太阳膀胱经起于眼内角的睛明穴（目内眦），向上经额部的攒竹穴到颅顶，与督脉的神庭穴交会，经过曲鬓等穴，而至通天穴后，与督脉的百会穴交会于巅顶。
分支：巅顶部分支，从巅顶百会穴分出至耳上角。巅顶向后直行分支，从巅顶下行至脑户穴入颅内络脑，复返出来下行项后的天柱穴下分为两支，其一支从大杼穴沿背中线旁一寸五分，下行至腰部的肾俞穴处络于肾，下属膀胱，再从腰下行，穿骶旁会阳穴，经股部后面，进入腘窝内。其另一分支从天柱穴下经肩胛上方内缘的附分穴，沿背中线旁三寸，直下过臀部，经髋关节后方的环跳穴，沿下肢外侧后缘下至腘窝，与前一支会合以后，下达腓肠肌，经外踝后面的昆仑穴，在足跟部折向前，经足背外侧至足小趾外侧端的至阴穴，与足少阴肾经相接。
膀胱经异常特征：小便不通，遗尿，癫狂，目痛，鼻塞多涕，头痛以及膀胱经循行部位疼痛（项、背、股、臀部及下肢后侧疼痛）等。